海拔高度
這是外在環境中對高山腦水腫症發生的最關鍵因子，由於當海拔超過2500公尺以上時，人體可利用空氣內的氧氣濃度大約為15.4%，已小於平地約25%的正常氧氣供給量，因此當人在短期內處於這種環境之下，將出現急性與慢性缺氧的各項症狀。
爬升速度
這是外在缺氧環境和內在人體狀況各項因素對高山腦水腫症發生的交替性關鍵因子，由於人體對環境具有很強的適應能力，因此當必要進入高山及高原地區時，只要依循著階段式的適應，將可以大幅度的降低高山肺水腫症的發生及損傷。
感冒感染
當準備進入高原或高山之前或時期中，應絕對避免發生感冒等症狀，否則最好應避免上山，因為這項因子除了極易混淆高山腦水腫症狀，並且有加重發生的高山肺水腫症的發生。
高血壓
高山腦水腫症的另特徵之一就是腦部呈現高血壓的發漲感，但對於已患有高血壓的人並不會對既有手臂上的血壓造成高升的現象，甚至可能反而有降低的趨勢，這是因為身體在極端缺氧環境下能量重新分配的現象，也就是血液重新集中到肺部及腦部，從一般的高血壓轉移造成肺部高血壓及腦部高血壓。
心律不整
心律不整基本上分成三類現象包括心跳過快、心跳過慢、及心速不規律，但是除了心跳過緩之外其餘對高山腦水腫症都有加重危險之慮。
正常人在平地時的心跳速度應該在72-75之間，但是當高度超過3000公尺之上時，因為缺氧之故將加速心跳速率，一般若沒有發生高山症者，他們的心跳將增加到80-82下/每分鐘，但是若發生高山腦水腫症者在修息時的心跳將增加達90-95下/分鐘，這樣的心搏速度對心律不整的人將產生致命的危險，尤其是心臟衰竭或心肌梗塞所導致的心律不整，將使原有的病灶加重之外，還將更容易啟發高山腦水腫症及腦中風的發生。
心臟衰竭
心臟無力或心臟衰竭等病因將直接地導致高山腦水腫症的發生。由於腦部血流的加速及腦部高壓的發生，是由於環境急速缺氧導致身體將血液重新分配到腦部以獲取更多氧氣的一種代償生理現象，由於血壓是心臟輸出量與血管阻力的乘積（BP=CO x TPR），同時心臟輸出量又是由心臟射血指數和心跳數的乘積（CO=HR x EF），當心臟越有力量時，心臟的輸出量也就越大，在滿足腦部能量及血壓的需求之下，心跳數將不易升高，同時血管也將越不會收縮。
對於心臟衰竭或因二尖瓣膜症等因素引起心臟無力的人，將因為在血液重新分配之際，迫使腦動脈收縮及腦水腫更加嚴重，同時也會大幅度的提高心跳數，一般來說大概會增加到90-95下/分鐘左右。這現象將使患者的心臟衰竭及高山腦水腫症預後變得越來越差。
貧血症
貧血症一般大致分為遺傳性的貧血（如地中海型貧血）、腎因性貧血（如慢性腎臟衰竭）、以及心因性的貧血（如二尖瓣脫垂症候）等類別，最後都是導致血液中的帶氧能力下降。
但是當處在高山或高原等缺氧環境之下，身體為了補償氧氣的不足將大量製造更多的紅血球及血紅素。這結果將使得血液的濃度快速變濃稠，在高山腦水腫症發生之際，將極易發生血管梗塞，進而轉變成腦中風等致命性的高山腦水腫症。
性別及年齡
由於男性的活動力及耗氧量總是比女性高出許多，另外再加上女性的體脂肪含量也較同齡、同重量的男子高，在缺氧時將有利於轉化成無氧代謝的原料。因此當處於極端缺氧環境下之時，男性的耐缺氧能力也就顯得較差。許多的研究已發現男性發生高山腦水腫症的比率明顯的比同年齡層的女性高出許多。
另外，身體的氧氣代謝功能常隨著年紀的增加而減少，一般而言當年紀達60歲時心臟的心輸出力也將下降至80%以下，而當70歲時則將下降至65%以下。因此年齡越大越容易發生高山腦水腫症。